Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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COPS9Q8WXC6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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COPS9Q8WXC6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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COPS9Q8WXC6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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