Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PALLDQ8WX93 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms