Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM41Q8WV44 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms