Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX3LQ8TDB6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX3LQ8TDB6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms