Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL11Q8NHH1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms