Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGBL3Q8NEM8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms