Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms