Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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