Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms