Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX3Q8N9I9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms