Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSL3Q8N5Y2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms