Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPUSD2Q8IZ73 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD2Q8IZ73 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms