Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB5

SMAP1, Stromal membrane-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAP1Q8IYB5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAP1Q8IYB5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAP1Q8IYB5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAP1Q8IYB5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAP1Q8IYB5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms