Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF2Q8IX21 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms