Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKAP1Q86WV1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms