Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP1Q86W92 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms