Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG4DQ86TL0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms