Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms