Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
STRCQ7RTU9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STRCQ7RTU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRCQ7RTU9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms