Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms