Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PQLC2Q6ZP29 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PQLC2Q6ZP29 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms