Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC2Q6ZN30 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms