Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREML4Q6UXN2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms