Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMARCD3Q6STE5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCD3Q6STE5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms