Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms