Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACHD1Q5VU97 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACHD1Q5VU97 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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