Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PDZK1Q5T2W1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PDZK1Q5T2W1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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