Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CEP170Q5SW79 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CEP170Q5SW79 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms