Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms