Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COLEC12Q5KU26 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms