Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A3Q5K4L6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms