Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms