Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms