Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms