Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms