Protein–RNA interactions for Protein: Q495M9

USH1G, Usher syndrome type-1G protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1GQ495M9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USH1GQ495M9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1GQ495M9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms