Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BBS9Q3SYG4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms