Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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KRTAP13-3Q3SY46 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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KRTAP13-3Q3SY46 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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KRTAP13-3Q3SY46 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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KRTAP13-3Q3SY46 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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KRTAP13-3Q3SY46 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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