Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P3H1Q32P28 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P3H1Q32P28 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms