Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UVSSAQ2YD98 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UVSSAQ2YD98 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms