Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPHKAPQ2M3C7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPHKAPQ2M3C7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
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