Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME3Q16798 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME3Q16798 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME3Q16798 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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