Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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