Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms