Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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