Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRADDQ15628 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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