Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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