Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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