Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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CNN3Q15417 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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CNN3Q15417 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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