Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 STIM2-205ENST00000473519 1328 ntTSL 57.11□□□□□ -1.275e-9■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 FEZ2-205ENST00000406220 430 ntTSL 36.66□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 STIM2-206ENST00000477474 770 ntTSL 25.81□□□□□ -1.485e-9■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.515e-9■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 25.58□□□□□ -1.525e-9■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 DEPDC5-212ENST00000462414 231 ntTSL 55.39□□□□□ -1.555e-9■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 517.73■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 MSL1-205ENST00000578826 962 ntTSL 214.66□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 DOCK1-202ENST00000464466 323 ntTSL 36.99□□□□□ -1.294e-6■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 TMEM164-206ENST00000464177 761 ntTSL 512.43□□□□□ -0.421e-10■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 31.8
PCBP2Q15366 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.241e-14■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CRIP2-211ENST00000552643 1383 ntTSL 223.53■■□□□ 1.361e-14■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CRIP2-204ENST00000547643 1373 ntTSL 321.73■■□□□ 1.071e-14■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CRIP2-205ENST00000548309 1893 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.561e-14■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CRIP2-207ENST00000548989 1976 ntTSL 218.47■□□□□ 0.551e-14■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CRIP2-203ENST00000538259 991 ntTSL 217.42■□□□□ 0.381e-14■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CRIP2-208ENST00000550577 817 ntTSL 211□□□□□ -0.651e-14■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 524.65■■□□□ 1.541e-19■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.861e-19■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt16.37■□□□□ 0.211e-19■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.321e-19■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KSR1-211ENST00000580163 479 ntTSL 320.39■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KSR1-217ENST00000583370 1041 ntTSL 316.19■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KSR1-215ENST00000582311 693 ntTSL 213.41□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KSR1-208ENST00000579309 343 ntTSL 55.48□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 526.54■■□□□ 1.841e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 524.4■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 324.4■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 224.4■■□□□ 1.51e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 523.48■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 523.35■■□□□ 1.331e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 517.08■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 316.64■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-249ENST00000490374 675 ntTSL 314.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-221ENST00000462499 492 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-241ENST00000482112 704 ntTSL 313.12□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-219ENST00000453292 632 ntTSL 512.38□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-206ENST00000349036 581 ntTSL 512.01□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-239ENST00000481039 756 ntTSL 510.45□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-247ENST00000488546 897 ntTSL 510.44□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-216ENST00000419558 729 ntTSL 39.98□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-218ENST00000450130 595 ntTSL 58.8□□□□□ -11e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 38.33□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GNAS-227ENST00000468895 583 ntTSL 37.77□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 519.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-208ENST00000562261 1065 ntTSL 314.08□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GTDC1-210ENST00000429978 586 ntTSL 414.04□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-212ENST00000564396 563 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 412.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 59.82□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 NSD2-221ENST00000511904 690 ntTSL 57.22□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GTDC1-213ENST00000467352 792 ntTSL 44.37□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GTDC1-209ENST00000417450 601 ntTSL 43.83□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 ZEB1-213ENST00000558832 570 ntTSL 47.16□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 PTPN23-206ENST00000602307 5119 ntTSL 211.83□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 WNK4-204ENST00000591448 3909 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 WNK4-203ENST00000587745 188 ntTSL 53.74□□□□□ -1.812e-9■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 FCHO2-204ENST00000507345 726 ntTSL 513.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 FCHO2-202ENST00000430046 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 48.82□□□□□ -19e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 31.7
PCBP2Q15366 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 31.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 242.8 ms